ویروس HIV-1 می تواند دفاع سلولی را با “فاکتور عفونت ویروسی (Vif)” خود خنثی کند. محققان موسسه علم و فناوری اوکیناوا (OIST)، ماتیاس ولف و تاکاهیده کونو به همراه یک تیم بین المللی از همکاران اکنون ساختار اتمی “مجموعه APOBEC3G-Vif” را با استفاده از میکروسکوپ الکترونی کرایو تعیین کرده اند.
یافته ها در منتشر شده است ارتباطات طبیعت در مقاله ای با عنوان “بینش های ساختاری در ارتباط با RNA پل زدن بین HIV-1 Vif و فاکتور ضد ویروسی APOBEC3G.”
محققان نوشتند: «تلاش زیادی برای کشف اساس تعامل A3G-Vif، رویداد کلیدی مکانیسم مقابله با HIV برای فرار از پاسخ ایمنی ذاتی ضد ویروسی انجام شده است». در اینجا ما بازسازی کمپلکس A3G-Vif و یوبیکوئیتیناسیون بعدی A3G را در شرایط آزمایشگاهی نشان می‌دهیم و ساختار cryo-EM مجموعه A3G-Vif را با وضوح 2.8 Å با استفاده از انواع تقویت‌شده با حلالیت A3G و Vif گزارش می‌کنیم.
توضیح داد: APOBEC3G (A3G) یک جزء کلیدی از سیستم ایمنی ذاتی انسان برای دفاع در برابر ویروس‌های مهاجم است، مانند اسب تروجان سوار بر ویریون‌های جوانه‌زن می‌شود تا بتواند DNA ویروسی را پس از رونویسی معکوس در سلول‌های آلوده تغییر داده و غیرفعال کند. ولف، نویسنده ارشد این مطالعه و رهبری واحد میکروسکوپ الکترونی کریو مولکولی OIST. اما HIV-1 یک مکانیسم واکنش متقابل به شکل پروتئین Vif خود ایجاد کرده است که این فرآیند را با اتصال به A3G و تخریب آن مهار می کند و منجر به تقویت موفقیت آمیز ذرات ویروسی عفونی می شود.
مطالعه آنها اولین نشان می دهد که این تشکیل پیچیده توسط توالی های RNA خاص واسطه می شود، حتی اگر DNA تک رشته ای بستر تخریب توسط A3G است. ساختار پروتئینی آنها برای حلالیت بالاتر بهینه‌سازی شده بود و می‌توانست مسیر تخریب را توسط یوبیکوئیتیناسیون A3G (فرآیندی که شامل انتقال پلی‌آبی‌کوئیتین‌سازی به پروتئین هدف و در بسیاری از عملکردهای فیزیولوژیکی مهم است) در شرایط آزمایشگاهی تکرار کند.
یافته‌های آنها نشان می‌دهد که تعامل A3G-Vif یک رویداد کلیدی در سرکوب سیستم ایمنی ویروسی برای غلبه بر دفاع میزبان است و یک هدف جدید بالقوه برای درمان‌های جدید علیه HIV-1/AIDS ارائه می‌کند.